아마존 검은 강 신학교는 인디오 출신 목사와 선교사를 양성하는 것이 주 목적입니다. 인디오 부족 복음화에서 지도자 양성 사역은 아주 중요합니다. 특별히 이 사역은 지금까지 백인 선교사들에게만 의존하였던 전통을 깨고 백인 선교사들에 비해 언어나 문화 면에서 많은 장점을 갖고 있는 인디오 출신 선교사를 양성할 수 있어서 아주 효과적입니다.

현재 외국인 선교사가 인디오 선교를 위하여서 입국하고자 하면 브라질 입국 비자를 받지 못하므로 더 이상 수급되지 못하고 브라질 국내 선교사 후보들이 모두 외국의 선교사 후보로 몰리고 있는 상황에서 인디오 신학교 사역은 아마존 강 유역 선교 공백을 인디오 출신 선교사로 메울 수 있는 유일한 대안입니다.

신학교 사역은 인디오 부족들 출신 교회 지도자를 양성하여 부족 교회들을 섬기게 하고 복음이 전해지지 않은 마을에 가서 교회를 개척하고 미전도 부족들에게 복음을 전할 수 있도록 하는 것입니다